《刀使之巫女》主要讲述了一群拥有特殊刀剑战斗能力的少女巫女们，在面对异界妖怪和各种挑战时，彼此之间的友情、成长与战斗的故事。故事围绕着主人公们的训练、战斗，以及她们在艰难情况下的选择与牺牲展开，展现了勇气与决心。
